Association between cell wall-related processes and functionally non-annotated factors important for K2 susceptibility

Abstract

Seventy one genes, previously determined as important for K2 killer protein susceptibility and not annotated in the Saccharomyces Genome Database (SGD), were analyzed by applying computational analysis and investigation of toxin binding efficiency. Links between 44 unknown ORF products and proteins related to cell wall processes were observed. Out of them, 17 single gene knockout mutants express the altered K2 toxin binding phenotype. The comparison of both approaches allowed assignment of 6 previously non-annotated gene products (Slp1, Tda1, Nba1, Ecm3, Ykr046C, and Ybr287W) as functionally associated with cell wall structure maintenance and biogenesis processes, confirming possible involvement in K2 receptor formation.

Atlikti tyrimai suteikia naujų žinių apie funkciniu požiūriu nežinomų Saccharomyces cerevisiae ASR charakterizavimą. 71 neanotuotas Saccharomyces Genomo duomenų bazėje ir susijęs su jautrumo K2 toksinui formavimu genas buvo tirtas taikant kompiuterinę analizę ir nustatant toksino surišimo efektyvumą. Apibrėžti ryšiai tarp 44 necharakterizuotų ir su ląstelės sienelės procesais susijusių baltymų. Nustatyti K2 toksino surišimo pokyčiai 17 neanotuotų mutantų. Palyginamoji kompiuterinių ir eksperimentinių tyrimų analizė leido funkciškai susieti 6 genų produktus (Slp1, Tda1, Nba1, Ecm3, Ykr046C ir Ybr287W) su ląstelės sienelės struktūros palaikymo ir biogenezės procesais bei apibrėžti tikėtiną dalyvavimą formuojant K2 receptorių.