Artimumo matų lyginamoji analizė Lietuvos populiacijos struktūros nustatymui
Abstract
Darbe nagrinėjami Lietuvos populiacijos genetinės struktūros nustatymo daugiamačių skalių, pagrindinių koordinačių ir pagrindinių komponenčių metodai, kai artimumo matai yra Euklido, Gower, Bray-Curtis, Kulczynski, Jaccard ir Morisita. Analizuoti 424 lietuvių plataus masto vieno nukleotido polimorfizmo genetiniai duomenys. Atlikta artimumo matų lyginamoji analizė. In this paper the multidimensional scaling, the principal coordinate and principal component methods for the Lithuanian population structure have investigated, taken that the proximity measures are Euclid, Gower, Bray-Curtis, Kulczynski, Jaccard and Morisita. The genome-wide single nucleotide polymorphism genetic data analyzed. A comparative analysis of proximity measures performed. The results of visualization are also presented.